不明原因的不孕，顾名思义，一定是不明原因，需要排除部分引起不孕的明确原因。女方需要排除排卵异常、输卵管因素、子宫内膜异常等引起不孕的常见因素。排除所有引起女方不孕的环节之后，男方仍需要排除部分导致不孕的绝对因素，临床上才能诊断为不明原因的不孕症。尽管称之为不明原因的不孕症，但一定有原因，只是临床上可能诊断不到。因此，个别的情况下还需要进一步地进行一系列的检查，比如需要进行子宫内膜异位症的检查，还有可能需要腹腔镜检查，观察盆腔内部，判断是否有导致不孕的客观原因。不明原因的不孕症只是相对结论，而不是真正的不明原因，只是临床上没找到导致不孕的真正原因。比如有部分患者因免疫因素导致，有部分患者因精子穿透力差导致，有部分目前临床上未找到原因，且有无法解释的导致不孕的因素存在。