目前甲亢的治疗首选药物治疗，二线治疗为手术和碘-131治疗。不主张进行手术和碘-131治疗，因为手术可能造成喉返神经损伤，以及其他问题，另外碘-131有放射性，故儿童甲亢最佳治疗方案是药物治疗。

部分儿童因中午在学校进食，一天三次服药不方便，而甲巯咪唑药物作为主要的甲亢用药，属于长效药物，一天一次或者一天两次服用即可，相对比较方便。另外，抗甲状腺药物主要副作用是白细胞降低、肝功能损害，甚至出现血管炎症性改变，但甲巯咪唑药物副作用相对较少，故可作为药物治疗的首选。