小儿先天性心脏病房间隔缺损自愈的可能性较小。缺损很小的情况下，观察即可；如果缺损比较大，需要密切的随访，尤其目前有介入手术的基础上，做相应的介入治疗干预，可以改变病人的预后。缺损比较大的患儿，如果没有早期发现、早期干预，会出现肺动脉高压、青紫型小儿先天性心脏病房间隔缺损，临床上需要避免出现此类情况，这是比较可怕的可能导致预后不良的因素。

小儿先天性心脏病自愈的可能比较小，早期干预会有比较好的临床效果。如果到中晚期，病人的发育滞后，反复出现肺炎或者呼吸道感染，出现青紫型房间隔缺损，临床表现为明显发绀，病人的预后较差。