隐睾最大的影响就是可能会影响生育能力，导致生育能力下降或不育。特别是腹腔型高位隐睾，由于腹腔温度比阴囊温度高1.5℃-2.5℃，睾丸长期停留在腹腔内，可因温度过高导致生精功能下降，出现生育能力下降。双侧隐睾患者可导致不育，同时隐睾可出现恶变，癌变。隐睾恶变几率较正常阴囊内睾丸高，隐睾位置越高，发生恶变的几率越高。
隐睾对于患儿的精神和心理影响较大，阴囊空虚或睾丸位置异常可使患儿产生自卑心理。年龄越大，对心理影响越大，可以引起精神担忧和痛苦。隐睾还会合并扭转或损伤，隐睾合并扭转或损伤时不易早期发现，容易误诊、漏诊，导致延误治疗，造成严重后果。因此，临床怀疑隐睾的患儿，一般建议6个月以后及时就诊，因为手术最佳年龄为6个月-1周岁。
