囊肿的治疗方法很多，包括针刺法、针吸法、针灸法、挂线法以及挤破法，但这些治疗方法复发率一般都较高。临床上发现，在3-6个月之内的囊肿，通过挤破方法可以治疗囊肿，但一般有40%-50%的复发率。针对3-6个月以上的囊肿，一般建议通过手术来治疗，找到囊肿壁，顺着囊肿壁找到蒂部，从而发现关节腔的破口，进行囊肿的完整切除，将关节囊壁缝合，后期病人可依靠瘢痕愈合。囊肿通常也不会再复发。有文献报道手术方法也存在30%-40%的复发率，但目前病人治愈率还是比较高的。