慢性肠炎根据其不同的病因，治疗方案也有所不同。慢性肠炎包括慢性细菌性痢疾、慢性阿米巴肠炎，及非特异性溃疡性结肠炎。在治疗方案中，主要包括抗病原体的抗感染治疗、抗炎治疗、一般治疗。在用药方面，以口服、塞肛、灌肠用药为主。如果是非特异性溃疡性结肠炎，用药方面以四朵金花为主，即柳氮磺胺吡啶类、激素、免疫抑制剂、生物制剂等。严重的慢性肠炎患者，建议定期复查肠镜，进行抽血等检查，根据肠镜和抽血检查，对治疗方案进行调整，通过以上的治疗，可达到结肠炎黏膜的愈合标准。