肝门胆管癌是胆道肿瘤，主要位于肝脏左右肝管交汇处。通常手术之前，往往难以取到病理进行确诊。术前难取到病理确诊，所以手术之前并不需要靠切片确诊。术前诊断主要靠症状，比如病人出现黄疸；靠肿瘤学指标，比如CA199升高，以及CEA、CA15升高，还有靠影像学检查，主要是增强CT、增强核磁，所以结合前面这些指标，基本上就可以确诊。
因为此位置比较特殊，一般手术之前难拿到病理，不像胃或者肠子的癌，可以经过胃镜或者肠镜取一块直接做病理，也不像肝脏实性肿瘤，可以进行穿刺，从中间取到一块，然后进行病理确诊。所以对肝门胆管癌，目前最常用的诊断方法，还是靠病史、临床表现、肿瘤学指标，以及影像学检查。
