胃间质瘤术后辅助治疗方法应根据胃间质瘤的复发风险度分级决定。对于高危、中危、低危的患者都要采取术后辅助用药。用药的选择需要根据胃间质瘤术后的基因检测结果，需要检测CD117等基因改变。如果没有特殊的突变，采取的是一线治疗用药，即格列卫来作为术后的用药，用药时间根据风险度的分级，中危、高危，风险度越高持续吃药的时间越高，直到复发。复发以后药物不能控制，换二线的用药索坦。如果索坦使用效果非常好，疾病得到控制可以继续服用。如果出现复发或者进展，就要调药的剂量。