腔隙性脑梗死作为临床常见的一类缺血性脑血管病，不同患者的临床表现不同。绝大多数患者没有特殊的临床表现，部分患者会表现为记忆力减退、步态的异常、吞咽的障碍等慢性的脑部疾病的症状。个别患者会表现为急性脑血管病的症状，如突发的肢体无力、突发的肢体麻木。如果在脑干部位发生腔隙性梗死，还可有严重的临床表现，出现严重的神经功能缺损，如肢体瘫痪、饮水呛咳，甚至有些患者还可出现意识障碍。

大部分患者以慢性损害为主，会表现出累加效应，随着腔隙病灶的增多，出现脑功能的损害，也就是血管性认知障碍，即老年性痴呆。腔隙性脑梗死会造成认知功能的损害，个别患者会出现步态的异常，类似帕金森的表现。