多数情况下两者检查的内容一样。阴超是通过腔内超声探头检查盆腔器官，包括子宫、卵巢等，其距离盆腔的位置更近，所以精确度和准确度更高，有条件者应尽量选择进行阴道超声。彩超本身是一种腹部超声，可以通过腹部检查盆腔器官，多数情况下适用于没有性生活，不能进行阴道超声检查的人群。但其缺点是要穿过腹壁，通过膀胱窗口检测盆腔器官的形态，所以需要多喝水、憋尿才能够有助于观察。但是腹部超声的优点在于若病灶比较大，而且达到腹部，腹部超声可以更为准确，更贴近于病灶。
这种情况往往见于巨大的卵巢囊肿或者巨大的子宫肌瘤，这些病灶已经超越盆腔，进入腹腔。这时经腹部彩超更为准确，所以有时需将两种超声相结合才能够做出明确的诊断。
