卵巢囊肿的手术目前对于良性卵巢囊肿而言，更多的是通过腹腔镜进行微创手术。所有手术都要以去除卵巢囊肿本身病灶，并且保护卵巢组织、卵巢功能不受影响为主要目的，同时在手术中还要减少出血情况。对于卵巢囊肿的手术，要求一定要避开月经期。在月经干净3-7天之内进行手术，可能会更加有利于病人。因为在生殖外科进行卵巢囊肿手术为主要目的，但同时还要保持或保留、维护病人的生育功能。
在手术过程中，对病人的输卵管以及病人的子宫内膜进行相关检查，为了达到多方面的目的，更适宜选择在病人月经干净3-7天的过程中进行手术，即病人的子宫内膜完全脱落，宫腔内呈相对洁净的环境，这样的状况有利于在手术中，既能完成卵巢囊肿的切除，也能更加准确地综合评价病人输卵管，以及盆腔内其它器官的生理功能。
