阴茎癌的发病原因，主要有以下几方面：

1、包皮过长、包茎，可引起局部微环境不佳导致反复慢性感染。因为包茎患者生殖器长时间不能得到及时、全面清洗，炎性物质、包皮垢积累会导致局部存在长期慢性炎症，这种慢性炎症可能会逐渐导致癌前病变、原位癌、阴茎癌发生；

2、病毒感染，如HPV感染，对于女性是宫颈癌高危因素，对于男性则是诱发阴茎癌危险因素；

3、基因问题，比如微卫星不稳定性、基因突变等，可能是外界和自身遗传基因相互作用导致的结果；

4、转移癌，比如其他肿瘤，通过血运转移到阴茎海绵体而导致阴茎癌，但发生几率相对非常低。