牙髓炎晚上疼是因为晚上平卧时头部体位变低，进入牙髓腔内的血流量增加，炎症区髓腔内血液循环较差，从而导致髓腔内局部压力进一步增加，压迫髓腔内神经而导致疼痛。当体位改变如站立或坐立时，疼痛可能有所减轻。

牙髓由丰富的血管和神经组成，四周有坚硬的牙本质包绕，犹如一个坚硬的堡垒，具有不可让性。主要通过狭窄的根尖孔与牙周组织相通，一旦发生炎症，其解剖结构使髓腔内炎症渗出物无法彻底引流，髓腔内压力增高，容易导致感染扩散、压迫神经，产生剧烈疼痛。