EST手术比较成熟，相对比较安全，其手术并发症具体如下：
1、类似于常规的胃镜检查，比如消化道损伤、出血、穿孔，术前通过告知患者使患者知情，此类并发症发生的几率相对较小；
2、跟EST手术相关的比较致命的并发症包括出血，较小的出血在手术过程中处理即可，但是如果是迟发性出血，几天后出现的大出血，此时可能致命。
3、术后胰腺炎的问题，术后单纯的淀粉酶升高没有问题，但是部分病人可能会发展为重症胰腺炎，可能对患者造成致死性损害。随着技术发展，术者经验越来越丰富，操作越来越熟练，此类并发症发生的几率很少，发生以后会采取相关的措施尽量弥补，减少并发症对机体的损害。
