特发性癫痫治疗也是跟普通癫痫有共通地方，首先一定要完善检查，要做24小时视频脑电图检查，甚至时间更长，也好明确发作类型，这里可能有肌阵挛、失神或者高复视率等，需根据脑电波进一步确定癫痫分类。同时也一定要完善头部磁共振检查，观察头部有没有器质性病灶存在，同时也可以完善儿童代谢的原因筛查，进一步确定癫痫原因，可以对家属进行相关检查。
治疗根据特发性癫痫原因选择，因为很多癫痫为特发性，很多倾向也是全面性发作，最好给予广谱抗癫痫药物，比如丙戊酸钠、氯硝西泮、托吡酯等药物，都是在特发性癫痫比较常用的。治疗期间除了观察药物的疗效外，也一定要针对患者肝功能、肾功能、血常规等血液指标进行监测。同时每年也一定要复查24小时脑电图和头部磁共振检查。