孕酮低对胎儿有影响，如果孕酮值很低，说明黄体功能不足，可能不足以维持妊娠而导致流产。另外孕酮低还有可能是胚胎发育不良的结果而不是原因，由于胚胎发育不良或者胚胎停育有时会引起孕酮值下降，一般孕酮<5以下属于孕酮值很低，可能是胚胎发育不良的表现。
但是孕酮在怀孕早期呈脉冲式分泌，并且具有波动性，所以孕酮值在怀孕早期并不如人绒毛膜促性腺激素一样呈现稳定或者持续增长的状态，而是出现上下波动。所以孕酮值如果是在十几到二十几，其实都是正常范围，不用因为孕酮值有所降低特别担心，怕胚胎发育不良。
建议在怀孕早期并不需要常规进行孕酮检测，通过定期进行超声检查，可以及时发现胚胎停育等问题，并不能单从孕酮值判断胚胎生长发育的情况。
