怀孕之后较高雌激素水平可能会诱发霉菌性阴道炎，部分患者是初发，部分患者是在怀孕之前患有霉菌性阴道炎，并且反复发作。虽然霉菌性阴道炎不会增加胎膜早破和早产风险，但是霉菌性阴道炎会导致瘙痒、白带增多等，影响生活质量症状。孕期治疗霉菌性阴道炎以缓解症状为主，主张用克霉唑或者咪康唑类药物进行阴道局部用药，而不能使用口服药物。

部分孕妇在孕期存在霉菌感染，但只是霉菌种植，并不一定有症状。对于此类情况多数医生主张不进行治疗，但有的国家主张在怀孕后期进行针对性治疗，原因是在怀孕后期治疗霉菌性阴道炎，可能会避免新生儿鹅口疮、尿布皮炎等情况发生。