胃间质瘤的诊断方法与其它肿瘤类似，患者需要做胃镜检查以及CT、核磁共振、B超等影像学检查。此外，还需要进行血液指标的检测。

胃间质瘤属于实体肿瘤，一般来源于肌层胃间质，与上皮组织来源的肿瘤不同，因此在影像学表现、临床症状方面需要专业性的诊断，主要是依赖于病理学诊断，经过免疫组织化学检测才可确诊。