胚胎停育后，最早出现的征兆是早孕反应减轻或消失。但是早孕反应本身就因个体差异而不同，所以不能用早孕反应来判断胚胎是否停孕。大多数孕妇胚胎停育后没有明显症状，如果发生胎停，母体会出现一系列改变，以利胚胎排出体外。首先是雌孕激素下降，还有血β-HCG明显下降，孕酮下降，机体对胚胎会产生一些免疫排斥效应，母体和胚胎之间血管形成血栓，然后发生离断，从而导致阴道出血。在胚胎排出过程中会出现下腹疼痛，这种下腹疼痛往往呈阵发性，当胚胎完排出后，腹痛消失，然后出血减少。