先天性隐性脊柱裂较轻时，孩子会出现疼痛，如腰背痛、下肢痛，手术以后基本能够消失。症状稍微重的孩子可能出现尿床或者白天小便憋不住、便秘等，再严重点的情况是一蹦一跳小便或大便就会漏出。最严重的情况是完全尿失禁或者大便失禁。

如果隐性脊柱裂存在脊髓栓系，通常在孩子1-2岁不会发病，因为孩子身体长得慢，所以栓系还不够紧。到孩子快速生长时，如4-6岁就开始长得高，所以栓系牵拉开始逐渐拉紧，从而出现症状。