肺结核的疗程根据具体情况而定，一般初治病人至少6个月，复治病人至少8-9个月，对于耐药结核病的病人至少是18个月。肺结核总治疗原则是早期、联合、规律、适量、全程，这五个方面缺一不可。如果能够遵从治疗原则，90%以上的病人能够治愈，且复发率很低，在5%以下。
早期指的是尽可能早发现、早治疗；
联合为几种抗结核药物联合应用，不能单一用药。因为不同抗结核药作用机制不一样，而结核分枝杆菌也存在不同代谢状态的菌群。联合用药能够发挥多种抗结核药的交叉杀菌作用，提高杀菌灭菌的能力。有的病人道听途说得了结核病之后自己去药店买利福平，自己在家吃。这种单一用药非常不可取，一旦产生了耐药，治愈率大大降低；
规律、适量也是防止耐药性产生的重要保证，剂量不足会导致治疗失败或诱发耐药，如果过量增加会导致不良反应；
全程指按照规定疗程完成治疗，是确保疗效的前提。很多病人在服药2-3周之后，症状就会得到基本控制，症状有可能会完全消失。但只是大部分敏感的结核菌被杀灭了，其它代谢状态的结核菌仍然存在，如果停药很容易复发。