头孢克肟片属于头孢类的强效抗生素，主要对革兰氏阴性杆菌、革兰氏阳性杆菌和部分厌氧菌有效。因为肛周脓肿通常是以革兰氏阴性菌和厌氧菌为主的混合性感染，所以患者可以服用头孢克肟片。肛周出现感染大概在第3天，或第4天的时候肛门周围会形成脓液，此时再用抗生素治疗通常效果不好。如果要用抗生素，通常是在肛周出现感染前3天内，及时应用抗生素可能会抑制住肛周感染进一步发展和蔓延。
3天后周围红肿会迅速进展，基本90%以上的肛周脓肿患者都需要手术治疗。一方面是抗生素的治疗效果较差，另一方面是患者即使能抑制住肛周脓肿的红、肿、热、痛等症状，可能在短时间内，如有劳累、久坐，或进食辛辣、生活不规律等，肛周脓肿就容易复发，因此对于肛周脓肿患者，大部分需要采取手术切开引流。
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