侵袭性胸腺瘤需要进行放疗、化疗、手术等综合治疗。目前认为Ⅲ期和Ⅳ期胸腺瘤分期靠后，称为侵袭性胸腺瘤。Ⅳ期患者以化疗为主，同时配合局部治疗，如放疗等。以前病理分型将胸腺瘤分为A、B、C、AB型，B型又有B1、B2、B3型，侵袭性按A、B、C的顺序递增。
目前已经将C型胸腺瘤单独列为胸腺癌，B型胸腺瘤之前按照分期治疗的原则处理。Ⅰ、Ⅱ期以手术治疗为主，Ⅲ、Ⅳ期需要综合治疗，即运用手术、放疗、化疗以及免疫治疗等方式进行治疗。