随着超声技术提高和超声医生对疾病认识的提高，大多儿童发生消化道疾病时首选进行超声检查，超声检查能够诊断儿童部分消化道疾病。

新生儿出生后胃扭转、十二指肠梗阻、十二指肠闭锁、十二指肠隔膜、环形胰腺，以及出生2周后吐奶婴儿的幽门肥厚、肠套叠、重复畸形等，可通过超声检查诊出。梅克尔憩室、急性阑尾炎等著名的急腹症，也可直接采用超声进行明确诊断，不需要其它影像学诊断。