卡氏肺囊虫肺炎目前更名为肺孢子菌肺炎，胸部CT在早期表现为肺泡和肺间质的弥漫性渗出性阴影，通常在CT中表现为磨玻璃密度的阴影，阴影的分布特征是双侧肺门弥漫分布的渗出性阴影，呈网状和小结节状的改变，病变迅速进展，表现为肺门的蝶状阴影。

还可以见到肺实变、支气管充气征，但是卡氏肺孢子菌肺炎在病变进展的时候，或者病变比较长时间存在的时候，还会出现肺间质的改变，甚至出现肺间质纤维化样的改变。