卵巢巧克力囊肿为卵巢囊肿其中的一种，卵巢囊肿可分为生理性及病理性。病理性又可分为卵巢巧克力囊肿、畸胎瘤、浆液性囊肿、黏液性囊肿。

巧克力囊肿属于卵巢囊肿的一种特殊类型，成分为血，有时称为巧克力囊肿，较长时间后可变成浓稠巧克力状。临床上患者可来月经，包块越来越大，症状主要表现为痛经和不孕，因此生育为巧克力囊肿最佳的治疗手段。巧克力囊肿治疗较特殊，其它卵巢真性肿物均建议手术，而卵巢巧克力囊肿需评估生育情况，多数患者可采取保守治疗，如戴曼月乐环。部分患者囊肿可自行停止发育，绝经后自动萎缩。