对于耐药肺结核的预防，应该按照正规的治疗原则，要早期、联合、规则、全程、适量用药原则进行抗结核的治疗，同时医生会制定个体化方案，患者必须要严格遵守医生的医嘱执行，定期监测，不可以自行调整药物或自行停药。
如果存在其它合并疾病，应该进行综合治疗，同时要改善个人生活习惯，饮食，保持生活规律，提升患者的免疫能力，提高抵抗疾病的能力。具体要去除感染源，如果发现耐药结核，应该及时到医院就诊，这是预防疾病的根本。因为耐药结核是通过飞沫传播，如果经常与耐药患者接触，应该保持距离在1m左右，同时要佩戴N95的口罩。如果是初治肺结核的患者，如果治疗效果不好，有会产生耐药的可能，建议一定要主动去专科医院就诊。
