卵巢囊肿手术后可能会复发，但这种病例非常少见，在临床上绝大部分囊肿在手术后都不会复发。但部分类型的卵巢肿瘤容易复发，如临床上容易出现双侧畸胎瘤，也就是两侧卵巢同时发现畸胎瘤，畸胎瘤术后容易复发。

子宫内膜异位囊肿也容易复发，又叫做巧克力囊肿，巧克力囊肿并不是新生肿瘤。子宫内膜异位在卵巢上，随着月经周期的改变，子宫内膜也会出血，但出血不能排出来，聚集在卵巢形成囊性改变称为巧克力囊肿，巧克力囊肿手术后很容易复发。