颅内动脉瘤好发于脑内血管分叉部。该部位是血流动力学最容易发生动脉瘤的部位，长期受到血流冲击会导致血管壁发生形态上的改变，其中又分为颈内动脉系统和椎基底动脉系统。

由于颈内动脉系统血流量大，发生动脉瘤的几率比椎基底动脉系统高。椎基底动脉系统的血流只有颈内动脉系统的1/2-1/3，因此椎基底动脉系统发生动脉瘤的几率低于颈内动脉系统。