肝内胆管结石的药物治疗，目前主要是针对肝内胆管结石，引起胆道感染时候的退热、对症消炎、解痉止痛的处理，目前尚没有确切的药物，能够针对肝内胆管结石进行消除治疗，肝内胆管结石目前最主要的治疗方法是依靠手术治疗。
如果肝内胆管结石平时没有症状，暂时不需要服药治疗，肝内胆管结石没有症状的时候，就定期复查随访。如果合并胆道感染的症状，再使用解痉、消炎对症的药物来控制症状。
一般如果肝内胆管结石反复引起症状，或者保守治疗无效的情况，这种情况就要及时考虑手术治疗，切除有结石的肝段，主要的目的是取净结石、通畅引流、预防复发。
肝内胆管结石如果引起肝萎缩，更要手术治疗，因为肝萎缩长期持续下去，可能导致胆管癌的发生，因此，针对这种情况一定要慎重对待，平时肝内胆管结石也要注意饮食调控，避免肝病胆管结石发作。
