包皮龟头炎治疗，常用药物有外用药和口服药。外用药物有百多邦即莫匹罗星，或者金霉素眼膏、红霉素眼膏等，有一定的杀菌作用。其他的例如碘伏、硼酸洗液等也具有消毒作用。
如果包皮龟头炎较严重，可能需要辅助口服药物，例如头孢类的头孢克肟、头孢丙烯等，或者喹诺酮类的左氧氟沙星，大环内酯的药物如阿奇霉素、磷霉素等，均有一定效果。
包皮龟头炎可能是疱疹病毒感染引起，可能需要进行抗病毒治疗，例如阿昔洛韦、伐昔洛韦等。还要注意包皮龟头炎，是否是性传播疾病，比如淋病、淋球菌感染引起，表现为尿道脓性分泌物。
同时包皮上发生炎症、水肿，这时需要采用敏感的药物治疗，比如头孢曲松钠，同时外用消肿药物，局部消毒药物。总体而言，包皮龟头炎除需要注意卫生、生活、饮食，必要时加用口服药物进行综合治疗，及时快速治疗包皮龟头炎减少复发。
