骶管囊肿90%以上的患者手术后效果很满意，但手术可能有一定后遗症，具体如下：

1、国内外报道，骶管囊肿术后出现脑脊液漏，如果没有及时处理，细菌可能到达椎管引起椎管感染，导致颅内感染，甚至威胁生命。因此如果做骶管囊肿手术，应注重将脑脊液漏口封堵严密，此时缝合伤口，发生脑脊液漏的可能性微乎其微，一旦发现有轻微脑脊液漏，需立即进行修补；

2、骶管囊肿术后疼痛相对常见，手术早期的疼痛为恢复过程的正常现象，无需特别处理。如果1年左右仍然有疼痛，采取疼痛科神经阻滞的方法可有效改善。