龟头流脓可能跟泌尿生殖系统的感染具有一定的联系，泌尿生殖系统的感染中比较常见的是包皮龟头炎，包皮龟头炎好发于包茎、包皮过长的男性。
包皮垢的积存可以引起细菌、支原体、衣原体、滴虫、真菌等聚集刺激感染。临床上会出现龟头红肿、疼痛，甚至出现糜烂、溃疡、脓性分泌物等临床表现，严重的反复感染甚至可以引起阴茎的鳞状上皮癌变。
通常龟头流脓以抗感染治疗为主，治疗的药物包括外用的、口服的抗感染药物，针对细菌或者真菌进行选择性的药物治疗。面对一些性传播疾病，如淋球菌、支原体、衣原体，以及疱疹病毒、梅毒等可以导致龟头出现异常临床表现的疾病时，要予以警惕。
必要时可以给予抗病毒治疗，为了避免女性患者同时患病，可以考虑夫妻双方同时进行治疗。
