肠镜的检查通常是在消化内镜室来完成的，消化内镜通常就是消化科的医生在操作，所以做肠镜的检查通常是建议来挂消化科。当然如果去挂肛肠科，因为直肠的病变可能不论是痔疮或者其它直肠的病变，就诊的时候建议做肠镜，但通常操作的医生是消化内镜的医生，消化内科的医生可以根据病史、临床症状在内镜下的检查的时候可能会更具有针对性，可以结合个人的情况，操作的时候可以交流病情，帮助更有效地完善检查，找到病变的原因，病变的部位，分析病变的情况，明确的诊断对患者的帮助会更大。
所以做肠镜挂消化科是可以的，较多医院在体检中心也可以完成预约肠镜检查。肠镜包括普通的肠镜和无痛的肠镜，如果是普通肠镜，做一般的预约检查即可，如果是无痛的肠镜，可能还要预约麻醉科的医生来共同完成，麻醉科的医生要判断是否具有严重的心脏、呼吸道疾病的可能，或者有相关麻药过敏的可能。如果排除了以上情况，即可做无痛的肠镜，无痛的肠镜预约可能时间会更长，费用可能会更多。但是如果疼痛的耐受相对差一些，还是建议做无痛的肠镜的检查，普通的肠镜挂消化科即可。