宫颈癌疫苗通常是在上臂三角肌区域进行肌肉注射，注射完宫颈癌疫苗后30分钟内不能离开医院，可能会出现过敏反应，如果30分钟以内，没有感觉即可回家。注射完宫颈癌疫苗后，注意注射局部可能会出现疼痛或红肿，甚至出现注射胳膊的疼痛，均属于正常现象，通常3-5天即可逐渐消失。另外，建议注射完宫颈癌疫苗后，应坚持定期进行宫颈癌筛查。
目前宫颈癌疫苗有二价、四价和九价，二价疫苗注射的方法是0个月、1个月、6个月注射，而四价和九价疫苗的注射方法是在0个月、2个月、6个月注射，上述疫苗均建议在6个月内注射完毕，通常只有注射完3针后，才能产生预防宫颈癌的抗体。另外，注射完疫苗的半年内同房要戴避孕套，一方面是避免怀孕，另一方面是预防HPV病毒(人乳头瘤病毒)传染。如果不小心发生怀孕，则要停止注射以后的宫颈癌疫苗，等到分娩以后，或结束哺乳期后再打。
