尿有臭味，大多数情况是因为尿路感染所致，这种情况女性多见。因为女性的尿道短且直，而且女性的尿道外口毗邻阴道和肛门。
男性通常泌尿系感染，一方面是包皮问题，包皮过长、包茎，这些包皮垢里的细菌会沿着尿道外口，入侵到尿路黏膜的上皮。另一方面，还有一些性传播疾病有关，比如淋病、支原体、衣原体所诱发的感染。
总之就是这些病原微生物，沿着尿道外口进入尿路黏膜上皮，造成尿路黏膜上皮充血、水肿、肿胀、渗血，甚至感觉神经外露。所以在临床上就会出现尿频、尿急、尿痛这一系列的临床表现。
同时尿路黏膜的上皮还容易脱落，这些上皮细胞，还有很多的蛋白质，大量的细胞碎屑再连同细菌，还有代谢的废物都泡在尿液里，所以容易使尿液发臭。这时候一般做尿常规，会发现大量的白细胞，细菌数也会有上升。
建议做尿菌培养加药物敏感实验，可以实验性的先采用传统的经验用药，比如使用喹诺酮类或者头孢类抗生素进行治疗。如果病原体检测显示是淋球菌或支原体、衣原体，可以分别以大剂量的头孢或者大环内酯类的药物进行治疗。
