包皮疼痛比较常见的是由于包皮龟头炎所造成，包皮炎或包皮龟头炎通常是由于男性对于包皮清洁不够，导致包皮垢聚积，从而引起细菌、支原体、衣原体、滴虫等微生物的感染，通常好发于包茎以及包皮过长的男性。建议对包皮进行定期的清洗，保持局部的干燥、清洁，必要时对于包皮龟头炎也可以采用外用的药物，包括百多邦软膏或抗真菌的软膏进行治疗。反复的感染引起包皮的疼痛、缩窄，也可以行包皮环切术进行治疗。
包皮的疼痛也可能是因为包皮的外伤、撕裂等造成，因此在临床上对于存在包皮畸形以及出现包皮感染，通常建议患者及时到男科或泌尿外科就诊，可以采用药物治疗，必要时也可以采用手术的治疗方案进行改善。临床上其它的疾病，如包皮的异物、嵌顿也会导致包皮的缺血，造成疼痛。
