小儿脑发育迟缓，需积极寻找病因，如是否存在慢性宫内乏氧，或出生时是否存在窒息、缺血、缺氧，以及出生后是否存在高胆红素脑病、中枢神经系统感染，都会导致小儿出现脑发育迟缓。这时主要针对原发病进行积极治疗，同时根据脑发育迟缓的临床表现，给予针对性干预治疗，如果小儿智力发育迟缓，可重点进行智力开发。

如果存在大的运动发育迟缓，则主要针对大运动方向，进行专项康复训练，可主动、被动训练相结合。如果小儿语言发育迟缓，则重点针对语言迟缓进行专项训练。通过不同程度的康复训练，改善小儿大脑发育迟缓程度。此外部分小儿大脑发育迟缓，可能是由于先天遗传代谢性疾病造成，如特殊的线粒体脑病，这时除康复训练外，还需配合特殊的药物进行治疗。