子宫内膜异位症的治疗要根据患者的症状、治疗目的、治疗要求进行，所以治疗方案因人而异。如果疼痛厉害，就给止痛，止痛的方法即吃一些非甾体类的止痛药。在中医里可以使用中医的辨证论治，中医治疗痛经非常有优势。中医可以扎针灸治疗。中医治疗通过吃中药、灌肠、敷药这些治疗都可以明显地改善痛经。如果说有不孕症状又有生育要求，就要促进妊娠。如果合并有巧克力囊肿，要去做腹腔镜手术，再结合着中药的治疗可以明显的提高的生育能力。