通常怀孕早期如并非存在特殊情况，不主张孕妇服药。怀孕早期，即孕前三个月时胎儿还没有完全长成，这时用药会对胎儿成长构成一定影响，比如导致胎儿畸形。此为早期不给孕妇服药的主要原因，即担心药物影响导致的胎儿畸形。

胆汁反流性胃炎患者在怀孕其它过程中可以适当服药，如患者疼痛由胃炎或者胆汁反流所致，可以给患者使用PPI制剂，即酸抑制剂、质子泵抑制剂和中和胆汁的药物。通常建议患者在医生指导下使用药物治疗。