在临床上造成龟头脱皮的原因比较多，对于包皮过长、包茎的男性，有时清洗不够、不注意卫生，会导致包皮垢聚积过多，会发现龟头脱皮，注意清洁会得到一定程度的改善。
其他病理性脱皮可能跟泌尿生殖系统感染有关，比较常见的生殖系统感染，如龟头炎、包皮龟头炎，通常是细菌、真菌、支原体、衣原体、滴虫等病原体所导致。通过抗真菌、抗细菌的药物，在治疗痊愈后，可能龟头会出现干燥、脱皮的现象。
反复的龟头脱皮要警惕传染性疾病，如疱疹病毒的感染、梅毒、性传播疾病。恶性肿瘤早期也可能出现脱皮的现象，在临床上要及早在专业医生的指导下进行判断和治疗。
