先天性输尿管狭窄主要原因及复发率如下：

1、先天性肾盂输尿管连接部梗阻：即UPJO，发生率约为1/800-1/600，男性多于女性，男女比例大概是2:1，左侧多于右侧，双侧者占10%左右。在所有接受手术患者中，根据手术方案不同，成功率有所不同，接受肾盂离段成形的成功率大概是90%-95%，复发率是5%-10%。接受经皮肾内切开或逆行肾盂内切开的患者，文献报道成功率大概是73.5%，复发率为27.5%左右；

2、先天性输尿管膀胱连接部梗阻：即UVJO，发病率大概是1/3000，男性多于女性，左侧多于右侧，双侧发生率大概是30%-40%。据文献报道，所有接受手术的患者中，成功率大概是90%，复发率为10%左右。