肛瘘是特殊疾病，肛瘘手术过程虽不复杂，但术后愈合较慢，复发率较高，患者术后疼痛会引起创面污染，而且本身是感染性疾病，所以术后不进行一期缝合，由其自然生长。
复杂性肛瘘手术后创腔总比创口恢复慢，是正常现象。术后关键是保持局部创面清洁，引流通畅。排便后不应直接擦拭肛门部位，以免刺激创面引起疼痛及出血。建议先用温水直接清洗，清除局部残存大便及其分泌物，再用温水坐浴，以改善局部血液循环，待自然晾干或用柔软毛巾擦拭，注意创面换药、外涂烧伤膏或祛腐生肌药物。
平时应注意饮食以清淡易消化食物为主，多食用蔬菜、水果、蛋白质食物，以补充维生素C，避免辛辣刺激性食物，同时保持大便通畅，防止便秘等。
