功能性子宫出血不是器质性原因，没有长肌瘤、息肉、囊肿，可通过药物治疗改善症状，比如口服避孕药、孕激素，这两大类药物可调节、改善内分泌，治疗功能性子宫出血。
功能性子宫出血的药物治疗一般是3个月，3个月后停下来看效果，通过正反馈的月经周期以及药物的帮助下建立正常机制，让月经自然来潮，再观察3个月，3个月之后如果每次月经都正常，治疗周期就可以结束。