乳腺导管内乳头状癌化疗主要产生的副作用包括恶心、呕吐等消化道反应，以及骨髓抑制、心脏毒性、周围神经毒性。

乳腺导管内乳头状癌化疗的副作用主要与药物的毒性有关，与疾病的类型无关。根据病情和病期，部分患者要做新辅助，或者要做术后辅助化疗，难以避免。化疗药是抗细胞毒类药物，通常使用阿霉素类和蒽环类、紫杉醇类化疗药物。