植物神经紊乱的患者，通常能够治疗。需在排除精神疾病的基础上诊断，进行抗抑郁、抗焦虑的药物治疗，通常可取得较好的效果。抗焦虑、抗抑郁的药物，主要包括黛力新、舍曲林，以及艾司西酞普兰、西酞普兰、文拉法辛、度洛西汀等。病人出现失眠的症状时，夜间可使用小剂量的抗抑郁药物，如盐酸曲唑酮、多塞平、米氮平 ，小剂量进行治疗，促进睡眠。

在植物神经紊乱的诊断上，需排除器质性疾病。部分植物神经紊乱病人表现为头痛、头晕，需排除颅内疾病。若病人表现为恶心、呕吐，需排除胃肠道是否有器质性疾病。若病人表现出心慌、胸闷、心前区不适的症状，需在心内科排除是否有心肌缺血或者其他的心脏疾病。