胆脂瘤手术的主要后遗症如下：

1、术后复发：术后是否复发与病变程度，以及患者病变范围有关。如果病变范围较大，手术无法彻底清除干净，可能再次复发。此外，与医生水平有关，即医生是否将病变清除彻底；

2、耳部流水、流脓：此现象持续时间长短，通常与病变范围以及选择手术方式有关。如果出现感染，流脓时间可能延长，若采用开放式鼓室成形术，外耳道与乳突形成大腔，可能流水、流脓时间较长，如1-3个月。但随着感染控制以及上皮化产生，耳部流水、流脓现象可消失。