甲硝唑注射液是临床上非常经典的一类抗厌氧菌抗菌药物，主要用于口腔、牙周感染，能在一定程度上缓解发炎疼痛，对于腹腔感染、女性盆腔泌尿系统、骨和关节等厌氧菌感染也有积极的治疗作用。此外甲硝唑注射液还可以用来治疗肠道及肠外阿米巴病、贾第鞭毛虫感染，也可以用来治疗阴道滴虫病，而且在治疗阴道滴虫病时，往往需要男女双方同时用药。
甲硝唑注射液的主要不良反应为胃肠道不良反应，少数病例可发生荨麻疹、皮肤瘙痒、口中有金属味、白细胞减少等，但均是可逆的，停药后可自行恢复，需要特别注意的是在用药期间不能饮酒，以免发生双硫仑样反应。具体用药要结合临床在医生的指导下用药。