先天性白内障主要为遗传导致，先天性白内障的遗传有较多机制，比如隐性遗传，即隔代遗传，以及显性遗传，如父母有先天性白内障，小孩也明确有先天性白内障。先天性白内障的遗传主要与基因有关，父母或者隔代亲人将遗传基因传给患者。或者父母都有携带基因，将先天性白内障遗传给患者。

除基因以外，部分患者不一定完全遗传，如妈妈在怀孕时感染病毒，发热或使用相关药物等，也会引起婴儿白内障。比如风疹病毒感染，妈妈在怀孕期间感染风疹病毒，也会导致生出的婴儿有先天性白内障。