胃镜检查通常不会引起较大痛苦，随现代科学技术发展，胃镜检查通常包括普通胃镜检查，即清醒状态下进行的胃镜检查，以及无痛胃镜。

无痛胃镜检查是指患者在睡眠过程中轻松完成的胃镜检查，因此患者不会出现不适感觉。普通胃镜从口咽部进入食道，检查过程中患者会出现轻微恶心。由于内镜技术的进步，内镜较软，因此患者不会出现明显咽部不适感，恶心症状也可减轻。此外，胃镜检查前会常规让患者口服口腔局部麻醉剂，以减轻不适感。